1846年（道光二十六年），清政府公开承认天主教是“劝人为善之宗教”，并同意把康熙、雍正年间没收而没有改作他用的教堂归还天主教会。但上海老天主堂的地产已改为关帝庙和敬业书院，按理不在归还之例。

一块康熙年代的石碑，证明这里确实是沙勿略临终之处。小堂后面丛林中竖立着十四处苦路石碑。这里的人们停止了嬉笑，严肃地朗读着基督苦难史，并有专人讲述着圣方济各·沙勿略的行实。（广东）

康熙立即将他逐出国门，康熙说“中国人的上帝就是真神，天不是物质的天，敬孔祭祖也不是宗教，只是孝心与敬心的表达，与基督信仰毫无冲突”。　　

据说康熙曾于59年（1720）南巡至此，并赐名“兰笋山”。

清朝康熙至道光年间，天主教时禁时弛，但民间还是薪火相传、生生不息。1845年，道光帝弛禁天主教，次年，法国天主教耶稣会长南格禄即从青浦迁居徐家汇，就地盖起了居所与临时教堂，天主教随之复兴。

据《钦定传信法》第二集14页载，教宗依诺增爵十一世于1678年（康熙十七年）8月16日颁发诏书，以大圣若瑟为中国传教事业的主保。

1707年，多罗在南京发布“祭孔祭祖”禁令，康熙大怒，将其押送至澳门。1804年（清嘉庆九年），罗马教廷任命在钦天监供职的遣使会士毕学源为南京主教。

康熙晚年的礼仪之争，传教士在中国的公开活动被限制，清廷敕修《四库全书》过程中又屏黜了“天学”中的“理”层面的内容，因而在一定程度上遮蔽了后人对“天学”的全面探究；近代以降，在中国处于半殖民主义和半封建的社会背景下

我国的犹太教旧称———赐乐业（以色列）在开封有寺，寺内有三碑：康熙碑说犹太教周时已传入我国；正德碑说是汉朝；弘治碑说是宋朝。

1671年，他奉康熙上谕，随同闵明我、恩里格到北京传教。此时，郑玛诺身患肺病，又加之水土不服，使病情加剧。在与病魔抗挣了一年之后，年龄不到40岁的郑玛诺于1673年5月26日在北京安息主怀。